Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEAL3Q969E4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321.1 ms