Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-CQ95604 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms