Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRG4Q92954 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
PRG4Q92954 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms