Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMO7Q8WWI1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
LMO7Q8WWI1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMO7Q8WWI1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms