Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COLGALT1Q8NBJ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COLGALT1Q8NBJ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms