Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO39Q8N4B4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO39Q8N4B4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms