Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC13Q8IYE1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC13Q8IYE1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms