Protein–RNA interactions for Protein: Q86WR0

CCDC25, Coiled-coil domain-containing protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25Q86WR0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC25Q86WR0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC25Q86WR0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms