Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms