Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PBRM1Q86U86 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
PBRM1Q86U86 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PBRM1Q86U86 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms