Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APTXQ7Z2E3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms