Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWH5

NEK10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK10Q6ZWH5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK10Q6ZWH5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK10Q6ZWH5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK10Q6ZWH5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEK10Q6ZWH5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK10Q6ZWH5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms