Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms