Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNL6

FGD5, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD5Q6ZNL6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
FGD5Q6ZNL6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
FGD5Q6ZNL6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FGD5Q6ZNL6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms