Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM72Q6ZMU5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms