Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CD109Q6YHK3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CD109Q6YHK3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CD109Q6YHK3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CD109Q6YHK3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CD109Q6YHK3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CD109Q6YHK3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CD109Q6YHK3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CD109Q6YHK3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CD109Q6YHK3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CD109Q6YHK3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms