Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TREML4Q6UXN2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREML4Q6UXN2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms