Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT2Q6UVM3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT2Q6UVM3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT2Q6UVM3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT2Q6UVM3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT2Q6UVM3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT2Q6UVM3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT2Q6UVM3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT2Q6UVM3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT2Q6UVM3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT2Q6UVM3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNT2Q6UVM3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms