Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms