Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC23A3Q6PIS1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A3Q6PIS1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A3Q6PIS1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms