Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms