Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLFN12LQ6IEE8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12LQ6IEE8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms