Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CARMIL2Q6F5E8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARMIL2Q6F5E8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms