Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATL3Q6DD88 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATL3Q6DD88 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms