Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A4Q6AI14 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A4Q6AI14 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms