Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX8Q68G74 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX8Q68G74 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms