Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIF1Q5UIP0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RIF1Q5UIP0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms