Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC3LQ5T215 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms