Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIVEP3Q5T1R4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms