Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NHSL1Q5SYE7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms