Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
FRMPD1Q5SYB0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FRMPD1Q5SYB0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms