Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF7

LINC01556, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01556, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01556Q5JQF7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01556Q5JQF7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01556Q5JQF7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms