Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF542PQ5EBM4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms