Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD12Q587J7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TDRD12Q587J7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TDRD12Q587J7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TDRD12Q587J7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD12Q587J7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms