Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39Q53RE8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms