Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC6LQ2NKX8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms