Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TXNRD1Q16881 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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TXNRD1Q16881 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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TXNRD1Q16881 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TXNRD1Q16881 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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TXNRD1Q16881 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
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TXNRD1Q16881 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
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