Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP6Q16828 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP6Q16828 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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