Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCBQ16585 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCBQ16585 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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