Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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