Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIV2LQ15477 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKIV2LQ15477 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms