Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNIP1Q15025 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNIP1Q15025 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNIP1Q15025 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNIP1Q15025 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TNIP1Q15025 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNIP1Q15025 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNIP1Q15025 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNIP1Q15025 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNIP1Q15025 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TNIP1Q15025 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TNIP1Q15025 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TNIP1Q15025 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNIP1Q15025 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP1Q15025 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP1Q15025 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP1Q15025 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP1Q15025 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP1Q15025 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP1Q15025 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP1Q15025 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP1Q15025 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP1Q15025 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP1Q15025 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP1Q15025 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP1Q15025 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNIP1Q15025 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNIP1Q15025 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNIP1Q15025 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNIP1Q15025 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNIP1Q15025 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TNIP1Q15025 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNIP1Q15025 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNIP1Q15025 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNIP1Q15025 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNIP1Q15025 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNIP1Q15025 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNIP1Q15025 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNIP1Q15025 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNIP1Q15025 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNIP1Q15025 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNIP1Q15025 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNIP1Q15025 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNIP1Q15025 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
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