Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA9Q13797 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA9Q13797 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms