Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX1Q13596 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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