Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF5Q13568 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRF5Q13568 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms