Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NEUROD1Q13562 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEUROD1Q13562 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEUROD1Q13562 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
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