Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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