Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
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PTPRSQ13332 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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PTPRSQ13332 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
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PTPRSQ13332 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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PTPRSQ13332 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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PTPRSQ13332 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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PTPRSQ13332 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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PTPRSQ13332 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRSQ13332 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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PTPRSQ13332 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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PTPRSQ13332 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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PTPRSQ13332 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRSQ13332 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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