Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTGDRQ13258 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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