Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD2Q13200 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD2Q13200 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms